Leider nicht - der Schwanzabschneider ist nun mal so konzipiert, dass er sich auf die Forumshauptdatei stuerzt.
Andere Frage: Existieren die entsprechenden Dateien noch?
Könnte man die in ein eigenes Verzeichnis kopieren und mit einem Perl-Skript den zugehörigen Teil der Forumshauptdatei separat generieren?
Dann könntest Du das Forum kurz sperren und diesen Teil einfügen ...