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Hallo Sven
Beide Sprachen haben ihre Besonderheiten
-Perl
Die ältere von beiden. Hat ihre große Stärke beim Umgang mit Textdateien und ähnlichem. Ist ausserdem auch ausserhalb des Webs einzusetzen. Manche Dinge sind aber etwas umständlich zu realisieren.
-PHP
Die große Stärke liegt im eleganten Umgang mit Datenbanken(MySQL).
Der Quellcode ist meist etwas schlanker und es gibt diverse Befehle die einem das Leben erleichtern.
Wenn du gerade neu Einsteigst, ist PHP eher zu empfehlen. Als Hilfe kann ich das PHP4 Buch von Jörg Krause empfehlen, teuer aber genial.
Tschüss Landschaf