Hallo !
Anhand des von dir angeführten Beispielcodes konnte ich das Problem nachvollziehen.
Der IE6 zeigt hier in der Tat einen unnötigerweise stets einen horizontalen Scrollbalken an, sobald ein vertikaler Scrollbalken ins Spiel kommt.
Siehe auch: [/?m=4807&t=782]
Lösung: Auf derartige Frameverschachtelungen verzichten.
Gruß,
kerki