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Wahrscheinlich steht der <script>-Tag bei dir im header.
Dann löscht er tatsächlich des gesamten Inhalt.
Also entweder du schreibst
<body>
<a href=""><script>document.write("Text");</script></a>
Oder, was eigentlich schöner ist:
<script>
document.soundso.innerHTML="Text";
</script>
<body>
<p id="soundso"></p>
Ist natürlich vereinfacht dargestellt. Wichtig ist das
id-Attribut.