Ohne Codesnippet etwas schwer zu sagen woran's liegt. Aber kann es sein dass es sich um ein Javascript in einer ASP handelt, in dem mit hilfe von document.write ein Script-tag geschrieben wird?
Dann musst Du die Script-tags vor ASP etwas "verstecken", zB. so:
document.write('<'+'SCRIPT language="Javascript">');
Genauso fuer '<'+'/SCRIPT'+'>'
Gruss, Mel