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Holladiewaldfee,
Ich muss noch dazu sagen, dass ich auf einem Win-Server mit installiertem Apache arbeiten muss, ich weiss nicht, ob das die Sache noch erschwert?
exec() sollte Dein Problem lösen, wenn Du das Perl-Script in eine eigene Datei legst und dann den Perl-Interpreter aufrufst.
http://de.php.net/manual/en/function.exec.php
Ciao,
Harry