Du könntest deine Script-Sektion einfach in deinen Body schreiben, dann wird er ausgewertet, sobald der Browser diesen Teil der Seite parsed.
<body>
...
<script type="text/javascript">
<!--
window.open (...)
//-->
</script>
...
</body>
Ist zwar etwas unsauber, aber müsst gehen.
Gruss,
Joerg