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Du verstehst offenbar das Prinzip von VPN nicht ganz.
VPN bedeutet, dass du eine Verbindung zwischen zwei Punkten herstellst, ähnlich wie wenn du dich per Modem bei deinem Provider einwählst, nur ist das Übertragungsmedium eben nicht eine Telefonleitung, sondern ein beliebiges Netzwerk.
Du könntest damit also sozusagen so tun, als würdest du dich mit dem Server in einem LAN befinden, obwohl möglicherweise tausende von Kilometer dazwischenliegen.
Dazu brauchst du einerseits einen VPN-Server und andererseits einen VPN-Client. Mit einzelnen Anwendungen, egal ob PHP, Perl oder sonstwas hat das eigentlich nichts zu tun, sondern mit dem Netzwerksystem der beteiligten Rechner.