Hallo,
http://httpd.apache.org/docs/2.0/mod/core.html#files
Wie weit reicht <files>?
Ich kann aus dem Manual irgendwie nicht nachvollziehen, wie ich es auf genau ein Directory beschränken kann, sodass es sich nicht mehr auf dessen Subdirectories auswirkt.
http://httpd.apache.org/docs/2.0/sections.html
Also entweder machst du mehrere <Directory> einträge in deinem httpd.conf oder mehrere .htaccess in den entsprechenden Verzeichnissen auf dem server, oder du benutzt <FilesMatch> mit dem entsprechenden RegEx.
Grüße
Thomas