Hallo wahsaga,
Über irgendeinen transparency-Parameter soll das bei aktuelleren Versionen des Flash-Plugins wohl gehen.
wmode="transparent" als Atribut im invaliden Embed-Tag und/oder
<param name="wmode" value="transparent" />
als Kindelement im Object-Element, wenn ich mich recht entsinne.
Dann ist Flash auch zugänglich für Z-Indizes.
Gruß Gernot