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Nein, das ist Unsinn.
Conditional Comments sind für den IE keine aktiven Inhalte. Suche die Ursache nach den Inhalten, die Du über Conditional Comments dem IE zugänglich machst - hier dürfte sehr wohl Javascript (oder "schlimmeres") mit enthalten sein.
ok, dann wars wohl folgendes, was in der css datei steht, die über das conditional comment eingebunden wird:
width:expression(document.body.clientWidth>905?"900px":"auto");
gruß, bernd