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Nimm #popup aus #main raus.
<div id="main">
</div><div id="popup">
</div>
Der Code wird remote eingebunden auf anderen Seiten, insofern habe ich absolut keine Kontrolle darüber, wie der umgebende Code aussieht.
Ich versuche nun über "appendChild" einen DIV container im <body> zu einzubinden mal sehen ob es darüber eine Lösung gibt.