Hallo,
Jedoch würde ich im Falle von Java (und Java3D) derzeit eher auf die offiziellen Pakete setzen, und nicht auf die, die die Distribution mitliefert.
Das sind auch die Pakete, die von Sun angeboten werden. Gerade deswegen, um solche Probleme zu vermeiden, verwende ich nur die Binaries von Sun und nicht von "blackdown", o.ä von Gentoo angebotene Pakete.
Markus