Wo muß denn im Header oder im Skript eine "Zeichenkodierung" sein? Hab noch nie davon gehört... sorry.. ;-)
Da du nicht sagst, welches Script, kann ich nur was allgemeines sagen. In PHP funktioniert das mit header(), bei PERL gibt es mehrere Möglichkeiten, entweder per CGI.pm oder einfach per print die Ausgabe machen.
Mehr erfährst du in der Doku der verwendeten Scriptsprache (oder was du eben verwendest)