Hallo Sven!
Natürlich, du kannst beides mit CSS relativ oder absolut positionieren und dann per z-index festlegen, dass das <div> über dem flash liegt. Bei meinem browser kriegt jedoch das Plugin auf jeden Fall den Zuschlag, sodass z-index nicht wirkt und ich den Inhalt des <div> nicht zu sehen bekomme (Opera 9). Daher ist das ausdrücklich nicht zu empfehlen!
Eine bessere Möglichkeit wäre, einfach mal im Archiv nachzulesen, was darüber hier schon alles geschrieben wurde.
Beste Grüsse
Richard