equin: Verknüpfung sehr großer Tabellen unmöglich?

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Hallo ich habe zwei Tabellen mit jeweils ca 45 000 Einträgen.

Wenn ich diese jetzt mit INNER JOIN verbinden will geht das bei einem eintrag grade noch (dauert ein paar Sekunden)

SELECT a.fel1, b.feld2 FROM a INNER JOIN b ON a.id = b.id WHERE id='1'

Aber wenn ich jetzt mehrere Einträge habe dauert es halt immer länger

SELECT a.fel1, b.feld2 FROM a INNER JOIN b ON a.id = b.id WHERE id='1' OR id = '2' OR id = '3'

Kann ich die Abfrage irgendwie besser stellen oder sind die Tabellen einfach zu groß?