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Mit einer callback-Funktion zum Beispiel. Die Waffe deiner Wahl wäre in diesem Fall preg_replace_callback() wobei die von dir verwendete Callback-Funktion mittels des dir sicherlich bekannten if-Statements unterscheidet, ob bereits ein ? an deinem Link hängt und daher gegebenfalls um ein "&" ergänzt.
Viel Spaß beim Umsetzen.