Danke!
Hm...habe mal versucht an der gewünschten Stelle mit Include eine Datei einzubinden die das Cookie setzt. Funktioniert aber wie erwartet nicht. Also blieben nur 2 Möglichkeiten: Den Teil in dem das Cookie gesetzt werden soll in eine neue Datei zu schreiben oder beim Durchlaufen des Teils automatisch eine Seite öffnen in der das Cookie gesetzt wird und direkt wieder schließen lassen. Oder?