Hallo,
Request -> Apache -> [Modul]/(PHP) -> [kompilierte Seite]/(PHP-Skript) -> Ausgabe
Das ist so ungefähr das, was bei Java-Webanwendungen mit JSP-Seiten passiert.
Die werden beim erstmaligen Aufruf in ein Servlet umgewandelt und kompiliert...
Gruß
Stareagle