ein paar kleine Änderungen und es sollte klappen!
<script type="text/javascript">
var eingabe = prompt ("Bitte geben Sie hier ein Zentimetermaß ein.","");
eingabe=parseInt(eingabe);
/* erstmal in eine Zahl umwandeln was eingegeben wurde */
if (eingabe > 100) {
var cm=eingabe%100;
/* cm erfassen */
var m=(eingabe-cm)/100;
/* demnach muss eingabe-cm die Meter ergeben. Runden ist hier völlig überflüssig */
document.write (m + "m und " + cm + "cm")
}
else {
document.write (eingabe + "cm")
}
</script>