Hallo Alex,
ich habe hier einen ganz merkwürdigen Fall wo shell_exec mit der oben genannten Fehlermeldung den Dienst quittert ... ABER: safe_mode ist definitiv aus und auch in den "disable_functions" ist shell_exec nicht eingetragen.
Eventuell ist Suhosin installiert und die Einstellung suhosin.executor.func.blacklist enthält shell_exec?
Viele Grüße,
Christian