Wie behandeln andere diesen unterschiedlichen Zugriff?
Sie verwenden zusammenhängende Dokumente und vermeiden (für diesen Zweck) Framesets.
Ist diese Rücksicht auf Zugriffe über Suchmaschen sinnvoll?
Nimm auf deine besucher Rücksicht - Suchmaschinen finden deine Seiten auch so irgendwie. zumindest auf einer Deiner Seiten wirst du wohl ein Vollständiges Frameset haben?
Quelltext auslagern ist das Stichwort.
Mit CSS kommst du imho nicht sinnvoll weiter.