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Du brauchst was zum abspielen von Musik/Tönen, da lautet die Empfehlung klar Flash. z.B. das hier:
Ich hab keine Ahnung, ob das Ding per JavaScript steuerbar ist, aber Du kannst Dir was basteln. Flash kannst z.B. per swfObject dynamisch in Deine Seite einfügen. Ergo auch "entfernen und neu einfügen", was einem Neustart gleich käme.
Diese Ansätze sollten sich zu einer gekapselten JS Funktion msgBeep() kombinieren lassen.