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Mit flv würde es gehen, es unterstützt aber nicht so hohe Auflösungen...
FLV ist ein Containerformat und nutzt als Codec üblicherweise H.263, H.264 oder VP6 - soweit ich informiert bin, kümmert sich der Container nicht um irgendwleche Auflösungsbeschränkungen, das ist rein eine Sache des eigentlichen Videokompressionsalgorithmus.
H.264 entstammt der MPEG-Familie und kann prinzipiell alles darstellen, was sich in 8x8 oder 16x16 große Pixelblöcke teilen lässt.
Bei 30 Frames progressiv erlaubt H.264 eine Auflösung von 4096x2048 Pixel.
Ich denke, das müsste deinen Anforderungen bei weitem entsprechen. Allerdings musst du bedenken, dass du zur Dekompression bei derart hoher Informationsdichte eine entsprechend leistungsfähige Maschine benötigst. Auf einem Netbook wird das kaum flüssig laufen.