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Hallo,
tja, warum die Startseite an Wert verloren hat ist komisch. Denn eigentlich sollten alle Seiten einen eigenen PageRank haben. PageRank bildet sich aus Inhalt, sauberem dazugehörigem Markup (h1, strong, etc.pp.) und Verlinkungen auf die Seite, die nach PageRank der verlinkenden Seite bewertet werden. Das steht aber auch alles in den Webdevelopertools bei Google selbst.
Gruß
jobo