Element in DOM einfügen / bei Ansicht des Elementes JS ausführen

[Beat]

Zuerst habe ich versucht in die getNutzungsentgelte.aspx einen Aufruf an die Javascript Funktion zum Berechnen der Größe zu machen.
Allerdings verliert sich dieser JavaScript-Code beim einfügen in mein PopUp-Div.

Im ersten Post schriebst du von der Methode ob.innerHTML. Dies erwartet natürlich reguläres HTML. Ich weiss nicht, was geschieht, wenn man auch ein script Element mit Javascript-Code einfügt. Ich bezweifle, dass der Code ausgeführt wird. Das eventuell meinst du mit "verliert sich".

Also habe ich nun versucht die Funktion zum setzen der iFrame Größe direkt nach der Funktion zum anzeigen des PopUp's ausführen zu lassen.

Ich sehe dein Problem mit dem Padding.
Wenn dein divPopUpContent eine absolute height hätte würde sich dein Problem schnell erledigen:
Wenn ich es richtig sehe, willst du, dass der iframe 100% der height und width der content-box des Eltern-Elements beinhaltet.

mfg Beat