Hast du jetzt in den Links index.php?content=foo oder switch.php?content=foo stehen?
<li><a href="switch.php?content=home"><div class="textInNavi">Home</div></a></li>
Da soll natürlich der Richtige Link stehen, also index.php sodass die Seite ganz normal funktioniert.
switch.php rufst du nur per JavaScript direkt auf, wenn du NUR den Inhalt brauchst, der sich ändern soll.
Dazu liest du einfach das href-Attribut aus und ersetzt dort index.php durch switch.php.