Was ist eigentlich genau der Unterschied?

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Auch deshalb JavaScripte als leztes im 'body' notieren. (Das erspart 'window.onload' und das Warten auf dessen Eintreffen.)

Ach, jetzt habe ich dich verstanden, du meinst eigentlich das gleiche wie ich. Scripte als leztes im body müssen nicht erst auf das Laden aller Elemente im body warten.
Das trifft aber nicht für Scripte zu. Die sind zu diesem Zeitpunkt alle abgearbeitet.