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Es gibt seit einiger Zeit auch einen SQL Server-Treiber für PHP von Microsoft:
http://msdn.microsoft.com/en-us/library/ee229551%28v=SQL.10%29.aspx
In der Beta-Version gibt's endlich auch PDO-Support. Läuft allerdings nur unter Windows ...
Wäre auf jeden Fall eine bessere Lösung als php_mssql (und PDO_MSSQL), AFAIK wird das nicht mehr weiterentwickelt.