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Das Konvertieren kann man auch mit den bereits genannten UNIXTIME-Funktionen in MySQL erledigen. Das ist meines Erachtens der effizienteste Kompromiss für beide Seiten.
Mit dem MySQL-Bordmitteln kastriert man sich aber möglicherweise die Daten:
http://dev.mysql.com/doc/refman/5.5/en/date-and-time-functions.html#function_unix-timestamp
"Note: If you use UNIX_TIMESTAMP() and FROM_UNIXTIME() to convert between TIMESTAMP values and Unix timestamp values, the conversion is lossy because the mapping is not one-to-one in both directions. [...]"