Multi: Mysql, auto_increment und das Ende der Spalte

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Was wird der Tabelle denn gelehrt? Das 1x1? Das große Latinum?

Tja, manchmal mache sogar ich Fehler ;)

Reicht da nicht eine Datenstruktur im Script?

Nein, da das Script mehrfach laufen kann, während der Datenverarbeitung. Ein Script füttert die Datenbank ein anderes (aktuell PHP, später Perl/TK) liest die Daten aus.
Das Bash-Script, das die Daten in die Datenbank schreibt wird aber von einem anderen Programm getriggert und mit den Daten gefüttert. Da dieses Programm durch einen Menschen bedient wird, ist es nicht vorauszusehen, wie lange die Dateneingabe dauert, wie lang die Liste der Daten ist und wann die Liste gelöscht wird.

Die einzige Alternative zu einer Datenbank wäre eine Datei. Da die Datenbank aber schon vorhanden ist und ich lediglich ne zusätzliche Tabelle brauche, ist ne Datenbank die einfachste Lösung.