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Machbar ist so furchtbar Vieles, deswegen frag ich mal, was so Mode bzw. am Gebräuchlichsten ist.
http://suit.rebell.at/artikel/passwoerter-richtig-und-sicher-speichern
O.g. 3 Dinge sollten 'drin' sein und es sollte kompatibel zu Perl und PHP sein.
Also hau' weg den Mist und verwende idealerweise das Portable PHP password hashing framework - das gibts auch als Perl-Modul
Ob du die Zugangsdaten in einer relationalen Datenbank oder in einer Textdatei ablegst ist eigentlich egal - das hat mit der Sicherheit relativ wenig zu tun.