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So wie ich das verstehe ist nodejs ein Serverseitiges Javascript.
Node.js ist im engeren Sinne ein Kommandozeilenprogramm, das JavaScripte ausführt.
Dass muss wahrscheinlich installiert werden
Du musst es nicht auf dem Server installieren. Du kannst die Scripte auch auf deinem Rechner minifizieren, bevor du ein Deployment vornimmst.
und läuft wie alles andere nur auf Linux Systemen?
Läuft auf Unix-Systemen genauso wie auf Windows.
Wieso sollte ich, um eine Javascript Datei zu verkleinern, eine komplett neue Technologie in mein Projekt einbauen?
Weil es die richtige Technologie für diesen Zweck ist.
Gibt es den Weltweit keine brauchbaren PHP Sachen die sowas schaffen?
JavaScript komprimieren erfordert einen JavaScript-Parser. Davon gibt es brauchbare in C++, JavaScript und Java.
Für PHP gibt es eine Portierung von JSMin. Das ist nicht wirklich ein brauchbarer JavaScript-Parser, deswegen würde ich darauf letztlich nicht vertrauen. Du kannst es allerdings probieren:
http://code.google.com/p/minify/
Mathias