Zu zufälligen Zeitpunkten, meistens bevor man einen Link anklicken möchte, werden sie klein und stehen dann mit den anderen Sitzungen nebeneinander auf dem Desktop.
Hast Du irgendwelche Effekte (Gesten, aktive Ecken) aktiviert?
Aber es gibt auch andere Zuckungen, die ein Arbeiten erschweren, immer ist das Fenster dann gesperrt und der nächste Klick dient der Wiederherstellung.
Genauer, der Auswahl des in den Vordergrund zu holenden Programmfensters
Seit ein paar Tagen habe ich einen zweiten Bildschirm am Laptop, das Problem tritt verstärkt auf.
Sehr wahrscheinlich, weil Du mit der Maus dann auch größere Strecken und Abschnitte von diesen schneller zurück legst. Es kann aber auch sein, dass Du diese "ungemein hilfreichen" Desktop-Ecken aktiviert hast. Dann musst Du natürlich über die "inneren" Ecken der beiden Bildschirme...
Literatur:
http://forum.ubuntuusers.de/topic/desktop-einrichten-aber-wie-geht-aktive-ecken/
http://forum.ubuntuusers.de/topic/aktive-ecke/?highlight=ecken#post-2231561
Denke Dir alles nur anders herum, Du willst ja deaktivieren.
Möglicherweise ist es sogar angenehmer, den ganzen compiz-haschmisch (a.k.a. "Desktop-Effekte", "Gewappel") einfach nur abzustellen.
Jörg Reinholz