C# Programm soll mit eigener Webseite Komunizieren

[unkown]

hm? die webseite ist immer offen auf dem rechner des nutzers

...

ich glaube der code liegt im client der webseite.

Dann musst du auf C# Seite einen Websocket Server implementieren/nutzen der mit dem Websocket Client im Browser kommuniziert. https://github.com/sta/websocket-sharp