Dumm gelaufen, würde ich sagen. Holzhammermethode: Alle Links und Referenzen, die konstant bleiben sollen (also auch dokumentinterne), als absolute Pfade mit Hostnamen ausschreiben, und nur die externen, die sich mal ändern könnten, relativ lassen. Dann wird base nur für diese wirksam.
Geht bloss nicht, weil die .html-Seite einen noch viel kryptischeren Namen hat als die externen Links. Sie liegt unter einem gaaaaaanz langen Namen bei baseportal und die eigentliche .html wird erst während der Laufzeit generiert - und es gibt in dem Dokument mindestens genauso viele interne wie externe Links - von daher hab ich jetzt die Wahl zwischen Pest und Cholera ...