DNS Server für Windows einrichten (dnsmasq)

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Dann musst du am "richtigen Router" das DHCP ausschalten, wenn es noch für dein Netz aktiv ist, damit du auf dem PI einen DHCP aufsetzen kannst,

Nein. Er muss den DHCP-Server nur an das Netzgerät (interface) binden an welchem er sein eigenes Netz einrichten will. Und in dem hat allerdings (jedenfalls nicht ohne weiteres) kein weiterer DCHP-Server was zu suchen.