Obwohl, mir fällt da gerade ein: Wird vermutlich damit nicht gehen, weil zu Beginn des Dokumentes, wo die JS Datei eingebunden wird die Elemente noch nicht existieren - sehe ich das richtig soweit?

Vielleicht hilft window.setTimeout(). Einfach das Element mit ein paar Sekunden Verzögerung einfügen lassen. Keine Ahnung, ob das funktioniert, probier das doch mal aus und sag uns, ob es den gewünschten Effekt erzielt. ;-)

document.onload = handlerfunktion;