Wenn du deinen Vhost (? oder eigener Server?) über htaccess dazubringen kannst html datein zu parsen is ok oder du hast einen besonders guten draht zu dem Serveradmin :-)
Das Problem ist, daß die Anzahl der php-Seiten im Verhältnis zu den reinen html-Seiten gering sind.
Genau deshalb würdest Du relativ viel unnötige Zusatzlast erzeugen. Wäre das Verhältnis umgekehrt, dann no problem.
Außerdem weiß ich nicht, ob man einzelne Domains herauspicken kann, oder ob alle auf dem Server befindlichen Seiten dann durch den php-Interpreter laufen.
Die Datei .htaccess wirkt für das Verzeichnis, in dem sie liegt, und dessen Unterverzeichnisse. Es ist also Deine Entscheidung, was wo wie interpretiert werden soll.