Hi,
wie Carsten schon sag: es sind zwei völlig verschiedene Systeme. Weder bei den CSS-Angaben noch beim Javascript wirst du mit einer Version auf beiden Browsern zufriedenstellende Ergebnisse erreichen. Meist ist für den NN4 eine Extra-Version erforderlich, während NN6, IE5 (und Opera 5) mit einer gemeinsamen (endlich) standardisierten Version auskommen.
NN4 ist da häufig der Klotz am Bein (IE4 auch nicht unbedingt weniger), stirbt aber zum Glück langsam aus. Irgendwo hier beim SELF-Kram gibt es 'ne Seite, auf der eine Browserstatistik zu finden ist: alle NN4.x so bei 12 % - es könnten ruhig weniger sein ;-)
m.