Hallo!
Richtig transparent geht nur in GIF oder PNG. Ich setze normalerweise die von dir angesprochene Methode der Zuweisung von Transparenz in Photoshop oder Fireworks ein. Natürlich wird dann aber das Hintergrundbild auch gleich in die Bildbearbeitung mit einbezogen.
Beim Export aus Photoshop .psd oder Fireworks .png geht rein visuell nichts verloren. Es werden nur alle Ebenen auf eine verschmolzen. Wenn also da der Hintergrund schon dabei ist, bleibt es auch so.
Vielleicht hast du mal ein Beispiel...?
Gruss
Christian