Hallo Andreas,
Ich bin nicht so sicher, aber das klingt ein bisschen nach dem Problem mit dem standardkonformen Modus im IE. Teste mal, ob das Problem auch auftritt, wenn Du im Doctype die URI zur dtd weglaesst. Das soll das laut W3C immer noch valide sein, bringt aber den IE dazu, den 'Geisterscrollbalken' wegzulassen. Vielleicht hilft's ja auch bei Deinem Problem.
Dieter