Nachtrag:
Das mit den Cronjobs in deinem Posting hatte ich erst überlesen ;)
Wie sieht deine Netzwerkauslastung aus?
Schonmal probiert, auf nen anderen SQL-Server zuzugreifen?
Gehts von der Kommandozeile? Erstmal solltest du eingrenzen, obs am Server, am CLient oder am Netzwerk liegt.