ich habe verschiedene V-Hosts eingerichtet und dort im "Directory" Bereich eine AllowOverride All eingefügt, um sicherzustellen, dass die Optionen aus der .htaccess auch greifen.
s.u.:
<Directory "\usr\projekte\home\html\software">
Options Indexes FollowSymLinks ExecCGI
Order allow,deny
AllowOverride All
Allow from all
</Directory>
vielleicht hilft Dir das ja weiter..
mfG Markus