Hallo Ilja,
je nachdem, wie stark das system ausgelastet ist, würde ich das über einen FULL OUTER JOIN der beiden Tabellen machen und nach NULL abfragen oder aber nach dem MINUS operator, falls mysql das kann.
MySQL kann derzeit noch _keinen_ FULL OUTER JOIN :-(
Siehe Einführung Joins.
Freundliche Grüße
Vinzenz