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Also du müsstest ganz einfach mit PHP/Perl(aber da kann ich dir nicht helfen) die Verzeichnisse auslesen auch die .ini Dateien, die neuen Verzeichnisse anlegen und dann mit Hilfe von PHP die nötige Verzeichnisstruktur JavaScript übergeben das diese dann weiterverarbetien könnte.
Das könnte dir/euch helfen: http://de2.php.net/manual/de/ref.dir.php
Wenn ich dir konkret einen Code schreiben soll müsstest du mir zuerst mehr Infos geben was denn genau gemacht werden soll.
GodLike
Struppi