Hi,
wenn ich dich richtig verstehe, hast du etwas ähnliches wie IntelliTXT o.ä. vor, du möchtest Wörter aus dem Quelltext der Seite durch Links mit einer bestimmten JavaScript Funktion ersetzen, dass dürfte prinzipiell kein Problem sein, ich würde mir eine einfache Schleife bauen und alle Elemente auf Textinhalte durchsuchen und ggf. mit <String>.replace('search', 'replace') die jeweiligen Wörter ersetzen, evtl. kannst du auch direkt:
Body.innerHTML = Body.innerHTML.replace('search', 'replace');
anwenden, wobei darauf zu achten wäre, dass auch HTML Spezifische Daten ersetzt werden KÖNNTEN.
Gruß!