Das Flashobjekt hat immer den höchsten z-index.
Gebe dem <object> und <param> Tag die Eigenschaft wmode="transparent" oder wmode="opaque", dann kannst Du dem Flashobjekt einen beliebigen z-Index geben.
Das Problem ist ja gerade, dass der Flashbanner dynamisch in die Seite eingefügt werde und ich daher keine entsprechenden Tags hinzufügen kann. Außerdem finde ich es "spannend", dass dieses Problem nicht bei ALLEN Flashbannern auftaucht. Leider konnte ich da bislang aber noch keine Regelmässigkeit feststellen können...