Hast Du Dein Zählpixel denn auch in andere Ressourcen (CSS, JS, Bilder, ...) eingebunden?
Vermutlich nicht, da das ja nicht geht ...
In CSS-Files könnte man sie zumindest als Background-Image referenzieren:
#sinnloser .selektor {
url(zaehlpixel.png);
}
Es ist allerdings fraglich, ob diese Ressource überhaupt aufgerufen würde, wenn der Selektor nirgends zutrifft und würde die Statistik mehr verzerren als es Nutzen hätte :)