Deswegen würde ich das als root machen wollen.
Dem wie vorgeschlagen also mit sudo passwd -u root
ein Passwort vergeben. Zumindest bei Ubuntu sieht dessen Eintrag in /etc/shadow sonst so aus:
root:!:16378:0:99999:7:::
Der kann sich also nicht direkt anmelden. Meldest Du Dich aber als martin an, machst sudo und kopierst /mnt/home/martin und, falls vorhanden, /mnt/home/.ecryptfs ins neue System dann hast Du nachfolgend sehr merkwürdige Erscheinungen...